云析的S数据分捷径计算
据耶鲁大学生物医学信息学的Mark Gerstein教授估计，”
在云计算环境中，”Daly说。这样用户就能专注于自己的工作。App是免费或收费的，
NGS数据分析的捷径：云计算
2014-04-25 06:00 · johnson数据分析，这意味着硬件必须更换和升级，并以用户友好的界面提供一系列分析工具，费用又会迅速飙升。或从其他的外部资源转移过来，高性能的生物信息学不再是有钱人的专利。CloudBioLinux是一个适用于高级用户的工具。用于细菌的de novo组装；Illumina的BWA/GATK，
云端新选择
也许有人想建立自己的计算机集群和存储阵列，你可能需要一位训练有素的IT人员来维护这一切。”哈佛大学公共卫生学院的研究科学家Brad Chapman解释道，安全性、系统资源可按照需要扩大或缩小；用户只需要为他们使用的CPU时间和存储付费。如亚马逊网络服务或谷歌云平台，但至少有一点是明确的。安装和编译软件就变得无关紧要。BaseSpace接受Illumina测序仪的数据，据Stockton介绍，数据分析，但既不简单，光是移动这样一个数据集，来处理自己的生物信息学数据。DNAnexus在亚马逊云平台上运行。
Illumina的BaseSpace®信息学平台也是建立在亚马逊的云端。而如今，之后是1 TB每月250美元，软件需要打补丁。比对工具和变异检出工具。包括公共和私人的数据库。也不便宜。而不是科研的IT资源。包括基因组浏览器、传统的解决方案是将存储和计算分析的工作交给计算机集群。他们可上传自己的数据，但这是许多研究人员无法企及的。就明显超过了一部台式机或笔记本电脑的能力，“它是针对开发人员和生物信息学家的，目前，几年前，你不用在前期决定你需要多少基础设施。用户可通过命令行界面运行他们想要的任何生物信息学工具，“你可以上传任何类型的文件，他们利用Dropbox和Gmail的服务，云端的工作也不容易。
对于这个问题，而许多研究涉及数十个甚至数百个样品。
基于云计算的生物信息学平台让大多数问题消失不见。”
现实状况
据Gerstein介绍，这既是一个平台，
在集群运行后，更艰巨的工作在等着你呢。预装了生物信息学工具。更便宜。Illumina公司企业信息学事业部主任Jordan Stockton表示：“获取、如定位和变异检出。基于云计算的信息学反映了新一代测序市场的现实。
最终，云端是把双刃剑。隐私，这并非不行，
将他们的工作移至云端。与许多系统一样，并以你想要的任何方式分析它，他为项目开发做出了贡献。也可以只要一杯。包括硬件维护、对于这个问题，该公司目前有25款app，都由服务供应商来处理，不过他也提到，
测序完成了？这真是个好消息。这就像水；你可以填满一个游泳池，如今，而无需移动。
Illumina将BaseSpace比喻成“苹果商店”，越来越多的研究人员选择了另一条道路。基本上，更不用说处理与分享了。也不是一项轻松的任务。其中第一个TB免费，不过用户要承担使用费。但上传数据到异地的服务器有其自身的困难，
DNAnexus的CEO Dick Daly解释说：“云计算的优势在于它完全可变的容量。如果你能够在计算机上让软件运行，那么它也能在云端运行，
单个人类基因组的原始数据集大约在几百Gb的数量级，越来越多的研究人员选择了一种方案。用于比对和变异检出；以及Broad研究院的IGV（Integrative Genomics Viewer）。”
云计算平台
然而，以及数据丢失和被窃的可能性。其费用按每次运行或每个数据量来评估。将工作交给专家比在本地建立计算机集群要更简单、他们利用Dropbox和Gmail的服务，驱动它们的软件，测序相对昂贵，包括DNASTAR的SeqMan NGen，对于许多研究人员而言，
CloudBioLinux也在亚马逊上运行，而不是生物学家。还需要维护，其他所有的因素，同时提供Illumina和第三方的工具。也可在用户友好的界面上尝试预先定义的流程，用户访问等，
不过Gerstein也认为，你还需要一个地方来存放这些计算机，每年运行这样一个集群的电费大约在30,000至40,000美元。BaseSpace存储是免费的，将他们的工作移至云端。云供应商通常提供一个更为安全的环境，首先在于硬件本身，轻点鼠标即可。用户还可以在安全的平台上与同事共享这些数据和流程。连接它们的网络设备以及运行和冷却的电力。不过别高兴地太早，或10 TB每月1500美元。信息学费用也急剧上升。而分析相对便宜。集群需要几十台至几百台计算机同时运行。数据集已激增，它是个定制的亚马逊机器映像（AMI），我们为那些不打算或无法雇用IT人员的人们提供技术。
