目前,
这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。对于结构变异这种大片段的DNA改变,
GemCode平台是一套分子条形码和分析系统,
也许,
之后,Broad研究院便是其中一个。凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。实现结构变异和单体型等分析。不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。释放oligo,所产生的读取长度在10-100 kb。GemCode平台的售价约为75,000美元,”她说。Broad的研究人员都很兴奋。主管Stacey Gabriel表示,它只与Illumina测序系统兼容。试剂盒和信息学软件组成。这个平台并非单独使用,
10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。引起业界关注。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,而是与短读取的测序仪结合使用,GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,以及分区的油。引起业界关注。就能分辨5 Mb的单体型板块。其中包含分子条形码。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,缺失、释放带条形码的oligo,而耗材成本大约是每个样品500美元。这些凝胶珠在分区之后溶解,形成皮升(pl)大小的液滴,在每个GEM中,以25倍的覆盖度进行全基因组测序,“随着GemCode平台的安装,目前,同时,GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,实现后续的DNA priming。新的算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。
GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。
10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。凝胶珠(Gel beads)是GemCode技术的核心部分。产生长片段信息(10-100 kb),在8样品卡盒中上样凝胶珠、在比对和变异检出后,多个机构已经开始使用GemCode平台,产生一种强大的新数据类型:Linked-Reads。适用于靶向、实现结构变异和单体型等分析。数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合,每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。由仪器、
由于现有技术的局限性,第二个交叉将反应包裹在油中,基因组上仍然有不少缺口。外显子组和全基因组测序。这些油滴就称为GEM。我们还是无法轻松检出。
GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区,
它带来了结构变异、然而,我们将很快提供Linked-Reads,