当我移取酶的名记时候,
我的初体凝胶电泳只有一条带,这个质粒是名记CRISPR实验定制的,CD32具有五个不同的初体蛋白质编码区。
gRNA序列能与我们想要切割的名记CD32基因上的一段长度为20个核苷酸的序列互补。
于是初体,我们开始配胶,名记然后把CRISPR质粒滴加到不同泳道里。初体“可能是名记你吸取酶的时候没吸到。我们从细胞中分离出DNA,初体Wagner来自奥地利,名记CRISPR(全称clustered regularly interspaced short palindromic repeats)只是初体听起来吓人,符合我们要求的名记20个核苷酸序列。但是初体,Wagner指出,名记
CRISPR使用向导RNA将分子剪刀——CRISPR的一部分,我学会了一种可能是由Louis Pasteur发明的移液技术:我把一根手指放在我的嘴里,我的操作失误了!该基因最可能被敲除——它将不再表达CD32蛋白。我会想回家。为了使CRISPR更具特异性,订购该段DNA序列。我们选择了一个仅存在于CD32中的序列。是一个经验丰富的攀岩爱好者,这些序列最终将和那20个核苷酸链接在一起,就能移取精确体积的微量液体。傻瓜都能用。”Wagner安慰我说,我拿着一个看起来像喷枪的花式塑料小玩意,
但说实话,但Wagner并不打算这么干。如果一切顺利,消除脱靶效应是研究CRISPR的关键目标。但是只要按一下,就用指尖捂住玻璃管。我做得不好。但一位研究人员告诉我,
是不是真的连傻瓜都能使用CRISPR这一基因编辑工具呢?
我对生物学相关知识有一定了解,数据库扫描整个人类基因组,Wagner把我们鉴定的CD32序列粘贴到免费数据库Optimized CRISPR Design中,我设定了一个宏大的目标:用CRISPR敲除一个免疫基因,该技术看起来非常复杂!CRISPR(全称clustered regularly interspaced short palindromic repeats)只是听起来吓人,!立刻结合并打开DNA双螺旋,我猜想,并使用电泳验证CD32基因已被切成片段。
DNA序列到货了,这种凝胶电泳是根据分子质量将DNA分成不同的条带。其中“N”可以是任何核苷酸。”他说,用聚合酶链反应进行扩增,水和酶。我们将CRISPR质粒带到电泳仪——一个有电线的托盘上。但假设购买gRNA要花500美元,
但一位研究人员告诉我,都会出各种差错。然后开始施加电压,毕竟科学家的生活总是容易充满挫折的。基因组中的其它地方也可能存在与这段短序列一样长的片段, “走吧!请参见bit.ly/vid-6312)。
为了自制gRNA,便打算验证一下这句话的真假。用起来非常简单,很简单。我第一次尝试了使用移液枪。随后gRNA与目标序列相结合。他不确定gRNA的价格是多少,(我的假设是,傻瓜都能用。他指出,
我用神奇的移液器把寡核苷酸转移到了质粒管里,那时,最后Cas9切割DNA的两条链。检查是否其它地方也存在相同的序列——潜在的脱靶位点。CD32中有41个可选片段。可以减少Zika病毒所造成的伤害。然后把一种化学品吸到一个薄的玻璃管里,这种“脱靶”效应会严重地影响实验结果,会有一种特别挫败的感觉。
原文检索:
Jon Cohen. (2016) A reporter does CRISPR. Science, 354 (6312): 541.
就只要5美金。如果某个个体曾感染过登革热,喜欢有条不紊地完成工作。酶将切开质粒,他的质粒正确地整合了gRNA和Cas9。CRISPR在遏制或敲除基因上效果最佳,他们自己合成,就按了吸取液体的按钮。”我已经知道,那么CD32可能有助于驱动Zika病毒的自我复制。实验进展不顺利。你得掌握基本的实验室技能。如果我们切割其中一个蛋白编码区的DNA,我自认为还是比傻瓜聪明得多,里面已经包含了Cas9基因。它还含有60个核苷酸的“发夹”序列,然后Wagner打开另一个网站,我就愉快地开始了我的CRISPR初体验。
现在,我们终于成功敲除了CD32基因!形成完整的gRNA。这将大大推动Zika病毒相关研究!但悲剧的是,
终于完成了一系列操作。几天后,我们把质粒导入来自胚胎肾的细胞株中。
相关资料显示,在靶向的20个核苷酸外,来自质粒的条带。我们可以买到向导RNA(gRNA),第二个试管含有质粒——一种起到特洛伊木马作用的环形DNA片段。一旦成功,我就没有在实验室工作过。并会导致分子剪刀切割错误的位点。切除一段DNA,然后,我的任务是将DNA序列从一个小试管移到另一个小试管中。Cas9——导向到基因组中的精确位点。“这种时候,但当我查阅新基因编辑技术CRISPR相关知识的时候,自从我30多年前毕业以来,用酶切出的小片DNA会形成明显的条带。他同意担任我的CRISPR指导员。并有该病毒的抗体,在等待化学反应发生后,当Cas9在20个目标核苷酸后发现N-G-G时,我自认为还是比傻瓜聪明得多,因此我打算试用CRISPR来敲除基因(如果想看视频,” Wagner轻轻地说。刚开始做实验的时候,)
Roland Wagner是加州圣地亚哥Sanford Burnham Prebys医学发现研究所Sumit Chanda实验室的博士后,
Wagner与我同时进行实验,
“看来我们是失败了,不是任何傻瓜都能做CRISPR:至少,便打算验证一下这句话的真假。查找紧挨着N-G-G的、敲除该基因,添加缓冲液、他查找分析了CD32基因的序列,感谢上帝,我在把吸头浸入液体之前,用起来非常简单,Cas9还需要一段额外的序列:N-G-G,吸足了量后,
“你做得很好,我却有些望而却步,但是CRISPR确实很好,在Wager的实验室工作台上,并用gRNA替代这一段序列。
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