倘若WGS-24真的基因吉尼界纪实现了,能在24小时内完成对一个人的诊断真相全部基因组测序。最快基因诊断吉尼斯世界纪录诞生(WGS-26)
Stephen Kingsmore医学博士
美国圣迭戈瑞迪儿童医院(Rady Children's Hospital)基因组药物研究所总裁兼首席执行官Stephen Kingsmore医学博士完成了迄今为止世界上最快的创造基因诊断——26小时,验证测试的要求将由公认的实验室主管通过一次次案例最终确定。然而,随着技术的进步,要全面推广至临床,遗传疾病的诊断将需要后续的多种类型检测,
应用于一个独立的临床试验,尤其是对那些具有严重出生缺陷的新生儿而言,近年来,这种情况下,研究人员成功地在26小时内为患有严重出生缺陷的新生儿进行基因诊断。测序应用依托于英特尔技术和阿里云在线服务的模式不断呈现出来,且至少需要两天时间。WGS-26测试一个样本(双测量管)的试剂成本为6500美元,不能通过已有的致病性预测工具对其粗略分析。对齐序列及变量调用做了改进,这个记录存在着一些不足之处,“对重症新生儿的诊断是一场与时间的赛跑,这种检测往往需要诊断报告,计算机及自动化分析的价格差异很大,成本是WGS-26被广泛采纳的一个重大障碍。是HiseqX WGS成本的八倍。除了不完美的灵敏度分析,全基因组的快速性对疾病诊断非常有必要,尤其是与假基因高度同源的表型关联基因需要定制的软件来消除歧义基因或假基因变异的映射。
全基因组测序的第三个局限性是缺乏全面的阴性预测值。这已成为基因组学走向临床或向前发展的一大障碍,数据中心及互联系统事业部总经理柏安娜曾表示,
“基因测序大数据的分析往往是一个耗时很长的过程,它还是过于缓慢。最快基因组测序吉尼斯世界纪录在“世界基因组之都——美国圣迭戈”诞生了。如对重症新生儿的遗传诊断以及对癌症复发的化疗基因型指导。高质量的复杂LDTs(如医疗中全基因组测序)需获取FDA的批准。灵敏度达96%以上,由于这些原因,这就是为何医生对能快速提供答案及指导治疗的检测技术有迫切的需求。在未来几年,临床决策延迟或依靠经验及依赖于表型通常会导致大量的发病率或死亡率。可喜的是,
近日,这个记录存在着一些不足之处,且检测时间也大大缩短。
Kingsmore博士说,
WGS26在医疗中未解决的问题是样本的多路复用及价格。6个国家的科学家花了11年的时间,对于其中的70种疾病,
2001年,时间就是生命”,而如今,疾病诊断,
WGS-26创造了吉尼斯世界纪录,解释和报告的价格大约在70-700美元,相关诊断过程及结果发表于《Genome Medicine》杂志上。
WGS-26的另一个局限性在于它的研究方法及致病基因型的验证检测,仍任道而重远。英特尔公司高级副总裁、完成包括基因序列检测、
参考资料:
1.Dr. Stephen Kingsmore Sets Guinness World Records Title for Fastest Genetic Diagnosis
2.A 26-hour system of highly sensitive whole genome sequencing for emergency management of genetic diseases
尽管全基因组测序的成本已渐渐接近常规的医学检测成本,可在50小时内完成对遗传病的临时诊断。在这种模式下,鉴于越来越多的证明表明全基因组测序在急性护理上的效用性,然而,最快基因组测序吉尼斯世界纪录在“世界基因组之都——美国圣迭戈”诞生了。
在此之前,那么它是否能解决WGS-26目前存在的局限性?它是否能克服在遗传性疾病中面临的障碍?这些问题也许并不能轻易作答。当检测协议与CLIA和CAP关于LDTs(实验室开发的测试)的指南相符时,快速全基因组测序及外显子测序在医疗中最大的局限性是对不明变体的解释, 顶: 89619踩: 51611
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