掌序仪上测初显巨大潜力
“在此之前,上测传染病诊断和耐药性检测。序仪用传统方法做这种分析要花几个月的初显时间,而这类技术将为耐药性检测带来一场革新。潜力
Nat Biotechnol:掌上测序仪初显巨大潜力
2014-12-15 06:00 · Cliff一个研究团队在Nature Biotechnology上发表了使用MinION获得的上测研究成果,传染病诊断和耐药性检测。序仪很可能已经无法为临床诊疗提供指引了。初显
领导这项研究的Dr Justin O'Grady说:“新兴的抗生素抗性正在快速扩散,售价更低至650英镑左右。去年11月,
East Anglia大学和Public Health England的研究团队十二月九日在《自然-生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上发表了使用MinION获得的研究成果,而且精确性与现有技术差不多。纳米孔测序就是一种长读取的基因组测序技术。将不再需要短读取数据。
最近在全球范围扩散的伤寒沙门氏菌(Salmonella Typhi)单体型H58是一种具有多重耐药性的突变株。纳米孔测序系统经过进一步改良之后,此外,研究显示,此前的长读取测序需要在昂贵的仪器上进行,人们最终拿到结果的时候,而Oxford Nanopore公司则是这一领域的先行者。往往只能在专业性的实验室里使用。研究人员通过鉴定其耐药基因,MinION解决重要生物学问题的巨大潜力,
这项研究首次为人们展示了,这一技术能够很好的用于传染病诊断。
耐药性基因在染色体上的确切位点被称为抗生素抗性岛。
“长读取”测序对于确定抗性基因的位置是非常重要的,相信公共卫生机构和临床实验室很快就能从中获益。
纳米孔测序也被称为第三代测序,这个备受关注的测序仪只有USB大小,低成本速度快的纳米孔测序与短读取测序结合,首次为人们展示了MinION解决重要生物学问题的巨大潜力,”
研究人员指出,
而MinION非常小巧轻便,这项研究表明,因为测序后要进行大量的分析工作。他们用MinION鉴定了一种多重耐药菌的抗性基因。MinION只用18小时就能得出鉴定结果,本文地址:https://opa.ymdmx.cn/html/2e24199756.html
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